GENEWIZのNGSプラットフォームとその仕様

Illumina
PacBio
10x Genomics
NanoString
Nanopore
Olink
MGI
Stomics


Illumina®

Illumina NovaSeq™ X Plus

 

Illumina NovaSeq X Plusは、新しいX-LEAP技術を採用して、さらなるハイスループットを実現したシークエンサーです。この技術は、高密度フローセルと高解像度のイメージングで比類なきスループットを実現し、一度のランで大量の高品質データを産出します。NovaSeq X Plus は、小規模研究をゲノムワイド関連研究に拡張し、迅速で実用的な結果を生み出してタイムラインを加速します。

アゼンタの GENEWIZマルチオミクス&遺伝子合成ソリューションは、研究用途 のみ(RUO) サービスに加えて、アメリカラボにおいて、CLIA 認定の 臨床全ゲノム および エクソーム シーケンシングアッセイと、CLIA /CAP ラボに適合した NovaSeq システムでの臨床グレードの探索的 RUO サービスも提供します。

 

Illumina MiSeq

Illumina NovaSeq™ 6000

 

Illumina NovaSeq 6000は 1 回のランで最大 3 兆塩基を配列解析し、1 週間という速さで、大規模で大容量データのゲノミクス研究プロジェクトに取り組むように最適化されています。イルミナサービスプロバイダーとして、GENEWIZ の最適化されたワークフローは高品質なデータを提供し、イルミナ自身のベンチマークさえも上回ります。イルミナS4 フロー セルは、4 つのシーケンシングレーンと、レーンあたり 20 億~25 億リード ペア (2x150 bp で 600~750 Gb) の出力を備えています。

研究用途のみのサービスに加えて、GENEWIZ は、アメリカラボにて、 CLIA/CAP 認定の NovaSeq システムで CLIA 認証の臨床全ゲノム およびエクソームシーケンシングアッセイ を提供しています

 

Illumina NovaSeq

Illumina NextSeq™ 2000

 

イルミナNextSeq 2000システムは、中規模スループットのシーケンスアプリケーションに対応し、菌叢解析やパネルシーケンスなどを中心に広範囲に利用されています。用途に合わせた様々なフローセルが展開されていますが、ジーンウィズでは主に2x300bpの比較的長いリード長のサービスで提供されます。

 

Illumina NovaSeq

Illumina MiSeq™

 

イルミナMiSeq は、アンプリコンや微生物ゲノムのシーケンシングを含む小規模なシーケンシング プロジェクト向けのプラットフォームです。構成には、2x150 bp (10~15M リード ペアで 4.5 Gb)、2x250 bp (10~15M リード ペアで 7.5 Gb)、および 2x300 bp (20~25M リード ペアで 13 Gb) があります。

ジーンウィズでは、主に大規模シーケンスの直前のプレランチェック(本解析前のパイロットラン)で利用します。これにより、インデックス配列の確認と、インデックスごとのデータ量の調整を実施し、インデックスホッピングによるデータ混合の原因を極力排除します。

 

Illumina MiSeq
 

MGI Tech®

DNBSEQ G-400シーケンサー

 

統合的なプローブ/アンカー合成技術(cPAS)およびDNAナノボール技術(DNB)の採用により、高いシークエンシング精度と高出力を可能にしています。これにより、同じデータ出力でもより多くの有効なデータを得ることができます。 

ショートリードシーケンサーとしてゲノム、トランスクリプトーム、メタゲノムのアプリケーションに対応しています。同時に、コストパフォーマンスにも優れています。

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PacBio Sequel
 

PacBio®

PacBio Revio™

 

PacBio Revio ロングリード システムは、以前の PacBio プラットフォームと比較して 15 倍のデータ スループットを提供することで HiFi シーケンシング テクノロジーを拡張しました。これにより、 1 日で最大 360 Gb の HiFi リードを取得可能になりました。このシステムは、高密度の 2,500 万 ZMW SMRT® セルを特徴としており、1 つの SMRT セルだけでヒトゲノムの 30 倍の HiFi カバレッジを実現します。最大 4 つの SMRT セルを並行して実行できます。ロングリード長 (最大 25 kb) と高い精度 (>99.9%) により、Revio は、de novo アセンブリ、網羅的な変異検出、単一細胞トランスクリプトミクス、エピジェネティック特性評価など、幅広いゲノム アプリケーションに最適です。

PacBio 認定サービスプロバイダーである GENEWIZ NGS ソリューションは、科学者がハイスループット シーケンシングのパワーとロングリードの優れた精度を活用して、ショートリード シーケンシングで可能な範囲を超えたゲノム解析を推進できるよう支援します。

 

 
 
PacBio Sequel

PacBio Sequel® IIe

 

PacBio Sequel IIe システムは、PacBio Iso-Seq® による転写産物アイソフォームの発見探索やアンプリコンライブラリのディープシーケンシングに最適です。ジーンウィズのエキスパートチームがサポートすることで、Sequel IIe システムから実用的なデータをより迅速に取得できます。PacBio の HiFi シーケンシング テクノロジーは、高い精度と長い読み取り長を同時に実現し、ゲノムとトランスクリプトームの包括的な視点を提供します。これは、研究者が、複雑な遺伝学的課題に取り組むのに役立ちます。

 

PacBio Ille
 

Oxford Nanopore Technologies®

オックスフォードナノポアシーケンサー Oxford Nanopore Platforms

 

Oxford Nanopore Technologies (ONT) は、DNA または RNA 鎖をナノポアに通すことで、生成された電気信号を迅速に分析し、リアルタイムの配列情報を提供します。この独自のアプローチにより、GC 含有量が多い領域や反復配列を含む領域など、大きな構造変異や複雑なゲノム領域を検出するためのロングリード シーケンシングが可能になります。

ジーンウィズで最も好評を得ているナノポアのアプリケーションは、迅速かつ安価なプラスミド全長シーケンシングサービス "Plasmid-EZ" (プラスミドイージー)です。ロングリード全ゲノム シーケンシングやアンプリコン シーケンシングなどのその他のアプリケーションについては、ジーンウィズにお問い合わせください。

 

 
 
PacBio Sequel

10x Genomics®

10x Genomics Chromium™ コントローラー

 

10x Genomics Chromium controllerは、マイクロ流体と分子バーコーディングを使用して、何万もの個々の細胞または高分子量 DNA 分子を分析します。アプリケーションには、シングルセルRNA-Seq、シングルセルV(D)J免疫レパトア解析、マルチオームATAC+遺伝子発現、固定RNAプロファイリングが含まれます。

ジーンウィズは、2018年に日本国内初のChromium プラットフォームを使ったサービスを開始し、多くの実績を積んでいます。そこで得られたノウハウにより、出張解析の実施といったプロジェクトの柔軟性、納品までの迅速性、データ精度を最大化しています。

 

10x Genomics

10x Genomics Chromium™ Xシリーズ

 

10x Genomics Chromium X シリーズは、第 1 世代の 10x Genomics Chromiumコントローラーのマイクロ流体を使用して、シングルセル解析をスケーラブルで多用途なソリューションにアップグレードします。拡張されたサンプル調製オプションを使用して、シングルセル遺伝子発現、免疫プロファイリング、ATAC、Multiome ATAC+遺伝子発現、およびFlex アッセイを実行します。生細胞と凍結細胞およびあらゆる組織に加えて、固定細胞サンプルも対象となりました。

ジーンウィズは、世界で3社のみが選定されている10x Global Clinical Research Organizations (CRO) の 1 社です。

 

10x Genomics
 

STOmics®

STOmics Stereo-seq 超高解像度空間的遺伝子発現

 

STOmics Stereo-seq技術は、直径0.22 µmという極小のDNA NanoBall (DNB)を、1センチ四方のチップ上に4億個という超高密度に配置することにより、1細胞以下の超高解像度を実現しました。polyA配列を捕捉する構造のため、全mRNAを検出対象としています。従来法(例 In Situ Hybridization)では難しかった網羅的な発現プロファイルを取得します。あらゆる動物種で適用できます。アゼンタは日本初の認証サービスプロバイダで、全工程を日本国内ラボにて実施します。

 

 
 
PacBio Sequel
 

Nanostring®

NanoString GeoMx™ デジタル空間プロファイラー

 

NanoString GeoMx デジタル空間プロファイラー (DSP) は、NanoString の nCounter® テクノロジーと組み合わせることで、形態学的プロファイリングと分子プロファイリングを組み合わせて、異種組織サンプルの高解像度分析を可能にします。蛍光染色された FFPE スライドから対象領域を選択し、事前に構築された RNA またはタンパク質パネルの明確な発現プロファイリングを行います。このプロセスは定量性が高く非破壊的であるため、単一の FFPE スライドから 100 プレックスを超えるプロファイリングが可能です。

 

 
 
PacBio Sequel
 

Olink®

Olink Protein Biomarker Detection

 

Olink Proteomics は、血清や血漿などのさまざまな生物学的サンプルからタンパク質含有量を高スループットで多重分析することを可能にします。ジーンウィズは、Olink Explore HT ワークフローで 5,000 種類を超えるタンパク質の分析を提供できることを誇りに思っています。さらに、Target や Flex などの小型の既製パネルも提供しており、カスタマイズされた Focus ターゲット パネルも採用しています。

ジーンウィズの広範な自動化機能と最高スループットの イルミナシーケンサー群を組み合わせることで、あらゆる規模のプロジェクトに対応できます。すべての Olink プロジェクトは CLIA 認定/CAP 認定ラボで処理され、重要な科学研究にさらなる信頼性基準を提供します。

 

 
 
PacBio Sequel